קמח קוקוס מציע מספר יתרונות בריאותיים. הוא דל בגלוטן, מה שהופך אותו לבחירה מצוינת לדיאטות נטולות גלוטן או לאנשים עם רגישות לגלוטן. בנוסף, קמח קוקוס עשיר בסיבים תזונתיים, שעוזרים בשיפור העיכול, מניעת עצירות ושמירה על תחושת מלאות לאורך זמן. הוא מכיל מעט פחמימות פשוטות וסוכר, ולכן הוא מתאים גם לדיאטות דלות פחמימות או דיאטות לניהול רמות סוכר בדם. קמח קוקוס מהווה תחליף בריא לקמח חיטה במתכונים שונים, במיוחד עבור מי שמחפש אלטרנטיבה טבעית ובריאה.